Medizinische / Pharmazeutische Chemie
Einführung
Die medizinische Chemie ist ein interdisziplinäres Gebiet, das sich mit der Entdeckung, Entwicklung, Identifizierung und Synthese biologisch aktiver Verbindungen befasst. Untersucht werden ihre molekularen Mechanismen, ihr Stoffwechsel und ihre Wechselwirkungen mit biologischen Zielmolekülen mit Hilfe von In-silico- (Chemoinformatik), In-vitro- und In-vivo-Methoden, um Selektivität, Wirksamkeit und Sicherheit zu bewerten. Vielversprechende Wirkstoffe werden zu Leitstrukturen optimiert, die in die präklinische und klinische Arzneimittelentwicklung einfließen können.
Datentypen
Daten in der pharmazeutischen/medizinischen Chemie können in drei Hauptkategorien eingeteilt werden: Synthesedaten, analytische Daten und (Bio)Assay-Daten. Während Synthese- und Analysedaten in der gesamten Chemie üblich sind, sind (Bio-)Assay-Daten zur Bewertung der biologischen Aktivität in diesem Bereich besonders wichtig.
ELNs und andere Tools
Für eine effiziente Datenverwaltung sollten die Werkzeuge auf Projekt- oder Gruppenebene auf der Grundlage der Arbeitsabläufe ausgewählt werden. Da Arbeitsabläufe oft methodenspezifisch sind, sollten Nutzungsrichtlinien und Metadatenvorlagen in einem Datenmanagementplan (DMP) definiert und dokumentiert werden. NFDI4Chem bietet eine auf die Chemie zugeschnittene RDMO-Vorlage.
Für die FAIR-Datenverwaltung sind elektronische Laborjournale (ELN) besonders nützlich für die strukturierte Dokumentation. Der ELN-Finder listet pharmaziespezifische Optionen auf, und eine Anleitung zur Auswahl eines ELN finden Sie hier.
Loading...Für die RDM-Planung und die Erstellung von DMPs eignen sich Tools wie RDMO und DMP-Online; viele Universitäten bieten lokale Instanzen an.
Daten veröffentlichen
Die Veröffentlichung von Forschungsdaten ermöglicht die Wiederverwendung durch andere Forscher. Die Wahl eines geeigneten Repositorys ist von entscheidender Bedeutung; siehe Choose a Repository für eine Anleitung.
Für Synthesedaten und analytische Daten werden spezielle Repositories wie Chemotion Repository (Synthesedaten), MassBankEU (Massenspektren) oder nmrXiv (für NMR-Daten) empfohlen. Für die dritte Datenkategorie ((Bio)Assay-Daten) ist derzeit kein optimales Repository bekannt, so dass das generische Repository RADAR4Chem empfohlen wird.
Herausforderungen
Im Vergleich zu vielen anderen Bereichen der Chemie ist die pharmazeutische/medizinische Chemie häufig anwendungsorientiert und kann zu Patenten und Produktentwicklung führen. ELNs benötigen daher robuste Audit-Trails, die bereits bei der Auswahl des Tools und der Planung der Datenveröffentlichung berücksichtigt werden sollten.
Unterschiedliche Datenformate und Analysemethoden stellen auch eine Herausforderung für ein gutes Forschungsdatenmanagement dar, vor allem dann, wenn ältere Instrumente nicht oder nur über Notlösungen in Netzwerke integriert werden können.
NFDI4Chem hilft Ihnen gerne bei der Bewältigung dieser Herausforderungen, und Sie können uns jederzeit über den Helpdesk kontaktieren.