Chemotion: Datenerhebung und Verarbeitung

Analysedaten werden in der Regel in einem vollständig digitalen Format erzeugt und gespeichert. Allerdings besteht häufig eine Diskrepanz zwischen diesen Daten, den zugehörigen Analysegeräten und dem Laborjournal, in dem die Experimente dokumentiert sind. Chemotion ELN löst dieses Problem, indem es die Integration von Analysegeräten in das ELN durch device integration ermöglicht. Diese Funktion erleichtert nicht nur die Verknüpfung von Geräten mit dem ELN und Experimenten, sondern ermöglicht auch die Fernsteuerung der Geräte. So können die Benutzer von jedem beliebigen Standort aus direkt im ELN den Gerätebetrieb verwalten, Messungen einleiten und den Fortschritt überwachen.

Wenn Analysegeräte an das Chemotion ELN angeschlossen sind, werden die Daten einfach an das ELN übertragen. Der Transfer ordnet die generierten Daten den Experimenteinträgen zu, indem er die Namenskonventionen für die Experimente verwendet. So werden analytische Daten nahtlos mit Experimenten verbunden.

In vielen Fällen können Analysegeräte Daten in proprietären Dateiformaten speichern. Um die FAIR-Datenprinzipien umzusetzen, kann Chemotion solche Dateien in das textbasierte Open-Source-Dateiformat JCAMP-DX. Diese Umwandlung erfolgt automatisch, sobald die Daten vom Analysegerät übertragen wurden. Das Chemotion-Tool ChemConverter führt diesen Prozess durch und speichert sowohl das proprietäre Dateiformat als auch das konvertierte Dateiformat innerhalb des ELN.

Generell unterstützt Chemotion Forscher bei der Datenerhebung durch halbautomatisches Metadaten-Mapping. Dabei identifiziert und extrahiert Chemotion Metadaten aus analytischen Datendateien und schreibt sie in die entsprechenden, standardisierten Eingabefelder.