Gebräuchlichste Datentypen und Datenformate
Auf der Grundlage der Ergebnisse einer [Umfrage] (https://doi.org/10.1002/zaac.202000339), die vom NFDI4Chem-Konsortium im Jahr 2020 durchgeführt wurde, und der jährlichen Interviews mit den Leitern der Repositorien, die vom Repositorien-Team der Task Area 3 der NFDI4Chem durchgeführt werden, wurde eine Liste der gebräuchlichsten Datentypen und -formate innerhalb der Chemie-Community erstellt, die in Tabelle 1 aufgeführt ist. Tabelle 1 zeigt, welche Datentypen in der Chemiegemeinschaft am häufigsten gesammelt werden, und gibt Hinweise darauf, welches Repositorium sich am besten für die Speicherung und Publikation Ihrer spezifischen Forschungsdaten eignet.
Die Empfehlungen in Tabelle 1 helfen Ihnen bei der effizienten und schnellen Auswahl des besten Repositorys für die Speicherung Ihrer Daten.
| Datentyp | Datenformat | Empfohlenes Repositorium | Kriterien für die Auswahl |
|---|---|---|---|
| Magnetische Kernresonanz | Bruker-Format (als ZIP), JCAMP-DX | Chemotion | Qualitätskontrolle, Kuratierung/Review vor der Veröffentlichung |
| Magnetische Kernresonanz | Bruker-Format (als ZIP), JOEL-Format, JCAMP-DX, NMReData, nmrML | nmrXiv | Validierungen / Mindeststandards für die Publikation der Daten |
| Massenspektrometrie | MassBank-Format siehe RMassBank | MassBank EU | Bestehen der Validierung, Kuratierung vor der Veröffentlichung |
| Massenspektrometrie | mzML, JCAMP-DX; Herstellerformate wie Thermo RAW werden akzeptiert und in Chemotion mit Proteowizard's msconvert nach mzML konvertiert. | Chemotion | Qualitätskontrolle, Kuratierung/Review vor der Veröffentlichung |
| IR und Raman | JCAMP-DX; bestimmte Herstellerformate werden von ChemConverter akzeptiert und nach JCAMP-DX konvertiert. | Chemotion | Qualitätskontrolle, Kuratierung/Review vor der Veröffentlichung |
| Röntgenbeugung | JCAMP-DX; bestimmte Herstellerformate werden von ChemConverter akzeptiert und nach JCAMP-DX konvertiert. | Chemotion | Qualitätskontrolle, Kuratierung/Review vor der Veröffentlichung |
| UV-VIS Spektroskopie | JCAMP-DX; bestimmte Herstellerformate werden von ChemConverter akzeptiert und nach JCAMP-DX konvertiert. | Chemotion | Qualitätskontrolle, Kuratierung/Review vor der Veröffentlichung |
| Cyclovoltammetrie | JCAMP-DX; bestimmte Herstellerformate wie Gamry DTA, Metrohm CSV und TXT und PalmSens PSSESSION werden von ChemConverter akzeptiert und in JCAMP-DX konvertiert. | Chemotion | Qualitätskontrolle, Kuratierung/Review vor der Veröffentlichung |
| Zirkulardichroismus-Spektroskopie | JCAMP-DX; bestimmte Herstellerformate werden von ChemConverter akzeptiert und nach JCAMP-DX konvertiert. | Chemotion | Qualitätskontrolle, Kuratierung/Review vor der Veröffentlichung |
| Dynamische Lichtstreuung | JCAMP-DX; bestimmte Herstellerformate werden von ChemConverter akzeptiert und nach JCAMP-DX konvertiert. | Chemotion | Qualitätskontrolle, Kuratierung/Review vor der Veröffentlichung |
| HPLC-UV-VIS | JCAMP-DX; bestimmte Herstellerformate werden von ChemConverter akzeptiert und nach JCAMP-DX konvertiert. | Chemotion | Qualitätskontrolle, Kuratierung/Review vor der Veröffentlichung |
| Größenausschlusschromatographie | JCAMP-DX; bestimmte Herstellerformate werden von ChemConverter akzeptiert und nach JCAMP-DX konvertiert. | Chemotion | Qualitätskontrolle, Kuratierung/Review vor der Veröffentlichung |
| Thermogravimetrische Analyse | JCAMP-DX; bestimmte Herstellerformate werden von ChemConverter akzeptiert und nach JCAMP-DX konvertiert. | Chemotion | Qualitätskontrolle, Kuratierung/Review vor der Veröffentlichung |
| Anorganische Kristallstrukturen | CIF | ICSD | Kristallstrukturdaten müssen vorliegen |
| Kristallstrukturen von organischen und molekularen anorganischen Verbindungen | CIF, andere Dateiformate werden unterstützt und akzeptiert | CSD | Zellparameter (Einkristall), vollständige Koordinaten (Pulver), im CIF-Format |
| Kristallstrukturen von anorganischen und organischen/anorganische molekularen Verbindungen | CIF, andere Dateiformate werden unterstützt und akzeptiert | gemeinsame CCDC/FIZ Access Structures Service | Mindestens eine CIF-Datei muss in der Einreichung enthalten sein und Strukturfaktordaten für alle Strukturen sollten (wenn möglich) bereitgestellt werden |
| Simulationen | 50 unterstützte Codes | NOMAD | Simulationsdaten, Erkennung beim Upload |
| Multidisziplinär | formatunabhängig | RADAR4Chem | Validierung gegen Metadaten-Schema |
| Daten zur Enzymkinetik | derzeit keine | STRENDA DB | Keine; STRENDA-konform, peer-reviewed Datenpublikation |
| Intermolekulare und supramolekulare Wechselwirkungen von molekularen Systemen | JSON (DataCite), CDX* (für 2D/3D-Molekülstruktur), PNG, proprietäre Formate | Suprabank | Plausibilität |